Un décret du 4 mars 2010 définit les missions des préfets de zone de défense et de sécurité. Le représentant de l'Etat dans la zone de défense et de sécurité est le préfet du département où se trouve le chef-lieu de celle-ci. Il porte le titre de préfet de zone de défense et de sécurité.
Sous l'autorité du Premier ministre et sous réserve des compétences du ministre de la Défense et de l'autorité judiciaire, le préfet de zone de défense et de sécurité est le délégué des ministres dans l'exercice de leurs attributions en matière de défense et de sécurité nationale.
A cet effet, il dirige les services des administrations civiles de l'Etat dans le cadre de la zone de défense et de sécurité.

Dans l’exercice de ses missions en matière de sécurité civile, il s’appuie notamment sur les services départementaux d’incendie et de secours de la zone de défense et de sécurité et un officier de sapeurs-pompiers est placé auprès de lui (article 13). Le directeur du service départemental d’incendie et de secours et, le cas échéant, les représentants des collectivités territoriales, peuvent être également associés, si besoin, aux travaux du comité de défense de zone (article 14).

Décret n° 2010-224 du 4 mars 2010 relatif aux pouvoirs des préfets de zone de défense et de sécurité, publié au JO du 5 mars 2010.